SIN PP | prof. dr hab. inż. Marta Kasprzak

1.

Genome-scale de novo assembly using ALGA / Sylwester Swat (WIiT), Artur Laskowski (WIiT), Jan Badura (WIiT), Wojciech Frohmberg (WIiT), Paweł Wojciechowski, Aleksandra Świercz (WIiT), Marta Kasprzak (WIiT), Jacek Błażewicz (WIiT) // Bioinformatics - 2021, vol. 37, iss. 12, s. 1644-1651

Artykuł naukowy 200 6,931
2.

Classification of de Bruijn-based labeled digraphs / Marta Kasprzak (WI) // Discrete Applied Mathematics - 2018, vol. 234, Special Issue, s. 86-92

Artykuł naukowy 25 0,983
3.

Graph algorithms for DNA sequencing - origins, current models and the future / Jacek Błażewicz (WI), Marta Kasprzak (WI), Michał Kierzynka, Wojciech Frohmberg (WI), Aleksandra Świercz (WI), Paweł Wojciechowski, Piotr Żurkowski (WI) // European Journal of Operational Research - 2018, vol. 264, iss. 3, s. 799-812

Artykuł naukowy 40 3,806
4.

GRASShopPER - An algorithm for de novo assembly based on GPU alignments / Aleksandra Świercz (WI), Wojciech Frohmberg (WI), Michel Kierzynka (WI), Paweł Wojciechowski (WI), Piotr Żurkowski (WI), Jan Badura (WI), Artur Laskowski (WI), Marta Kasprzak, Jacek Błażewicz (WI) // PLoS ONE - 2018, vol. 13, iss. 8, s. e0202355-1-e0202355-23

Artykuł naukowy 40 2,776
5.

Tabu search for the RNA partial degradation problem / Agnieszka Rybarczyk (WI), Alain Hertz, Marta Kasprzak (WI), Jacek Błażewicz (WI) // International Journal of Applied Mathematics and Computer Science - 2017, vol. 27, no. 2, s. 401-415

Artykuł naukowy 25 1,694

1.

Labeled Graphs in Life Sciences - Two Important Applications / Piotr Formanowicz (WIiT), Marta Kasprzak (WIiT), Piotr Wawrzyniak (WIiT) // W: Graph-Based Modelling in Science, Technology and Art / red. Stanisław Zawiślak, Jacek Rysiński - Cham, Switzerland : Springer International Publishing, 2022 - s. 201-217

Rozdział w monografii naukowej 20
2.

A heuristic approach to the treedepth decomposition problem for large graphs / Sylwester Swat (WIiT), Marta Kasprzak (WIiT) // W: Graph-Theoretic Concepts in Computer Science : 47th International Workshop, WG 2021, Warsaw, Poland, June 23–25, 2021, Revised Selected Papers / red. Łukasz Kowalik, Michał Pilipczuk, Paweł Rzążewski - Cham, Switzerland : Springer International Publishing, 2021 - s. 169-181

Rozdział w monografii naukowej / referat 20 140
3.

Ties between graph theory and biology / Jacek Błażewicz (WI), Marta Kasprzak (WI), Nikos Vlassis // W: Handbook of Graph Theory / red. Jonathan L. Gross, Jay Yellen, Ping Zhang: CRC Press, 2013 - s. 1559-1579

Rozdział w monografii naukowej

1.

Wybrane algorytmy i modele grafowe w bioinformatyce / Marta Kasprzak (WI) / Poznań, Poland : Wydawnictwo Politechniki Poznańskiej, 2013 - 204 s.

Monografia naukowa
2.

Combinatorial models and methods for reading genomic sequences / Marta Kasprzak / Wydawnictwo Politechniki Poznańskiej, Rozprawy / Politechnika Poznańska, 2004 - 109 s.

Monografia naukowa / rozprawa habilitacyjna

1.

Combinatorial models and methods for reading genomic sequences / Marta Kasprzak / Wydawnictwo Politechniki Poznańskiej, Rozprawy / Politechnika Poznańska, 2004 - 109 s.

Monografia naukowa / rozprawa habilitacyjna

1.

Informatyczne aspekty zagadnień sekwencjonowania łańcuchów DNA / Marta Kasprzak / prom. Jacek Błażewicz, rec. Marek Kubale, Wojciech T. Markiewicz, Jan Węglarz - Poznań, Polska, 1999 - 84 s.

Rozprawa doktorska

1.

Algorytmiczne aspekty modelowania i ewaluacji biomolekuł / Maciej Antczak (WI) / prom. Marta Kasprzak (WI), Piotr Łukasiak (WI), rec. Wiesław Nowak, Krzysztof Giaro - Poznań, Polska, 2013 - 236 s.

Rozprawa doktorska
2.

Genome Sequencing: Algorithms for New Approaches / Aleksandra Świercz / prom. Marta Kasprzak, rec. Tadeusz Morzy, Franciszek Seredyński - Poznań, Polska, 2007 - 142 s.

Rozprawa doktorska

1.

Modele grafowe i algorytmy dla klasycznego problemu sekwencjonowania DNA przez hybrydyzacje oraz dla jego odmiany z informacja o powtórzeniach / Kamil Julian Kwarciak (WI) / prom. Piotr Formanowicz (WI), rec. Sebastian Deorowicz, Marta Kasprzak (WI), Wojciech T. Markiewicz - Poznań, Polska, 2014 - 110 s.

Rozprawa doktorska
2.

Zastosowanie metod opartych na teorii grafów do rozwiązywania wybranych problemów analizy sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych / Tomasz Głowacki (WI) / prom. Piotr Formanowicz (WI), rec. Andrzej Świerniak, Maciej Stobiecki, Marta Kasprzak (WI) - Poznań, Polska, 2013 - 110 s.

Rozprawa doktorska
3.

Analysis of RNA Sequencing Data Using Data Mining Methods to Find Novel Transcriptomics Phenomena / Anna Leśniewska (WI) / prom. Tadeusz Morzy (WI), rec. Marta Kasprzak (WI), Marzena Kryszkiewicz - Poznań, Polska, 2012 - 168 s.

Rozprawa doktorska
4.

Modele i algorytmy rekonstrukcji ewolucji genów / Paweł Kędziora (WI) / prom. Jacek Błażewicz (WI), rec. Marta Kasprzak (WI), Franciszek Seredyński - Poznań, Polska, 2011 - 162 s.

Rozprawa doktorska
5.

Dopasowanie wielu sekwencji: analiza dokładności, algorytmy / Paweł Wojciechowski / prom. Jacek Błażewicz, rec. Marta Kasprzak, Franciszek Seredyński - Poznań, Polska, 2010 - 184 s.

Rozprawa doktorska