W zależności od ilości danych do przetworzenia generowanie pliku może się wydłużyć.

Jeśli generowanie trwa zbyt długo można ograniczyć dane np. zmniejszając zakres lat.

Artykuł

Pobierz plik Pobierz BibTeX

Tytuł

How Short RNAs Impact the Human Ribonuclease Dicer Activity: Putative Regulatory Feedback-Loops and Other RNA-mediated Mechanisms Controlling microRNA Processing

Autorzy

[ 1 ] Instytut Informatyki, Wydział Informatyki, Politechnika Poznańska | [ P ] pracownik

Rok publikacji

2016

Opublikowano w

Acta Biochimica Polonica

Rocznik: 2016 | Tom: vol. 63 | Numer: no. 4

Typ artykułu

artykuł naukowy

Język publikacji

angielski

Słowa kluczowe
EN
  • ribonuclease Dicer
  • miRNA processing
  • regulatory RNAs
  • regulation of Dicer activity
  • regulatory feedback-loops
Streszczenie

EN Ribonuclease Dicer plays a pivotal role in RNA interference pathways by processing long double-stranded RNAs and single-stranded hairpin RNA precursors into small interfering RNAs (siRNAs) and microRNAs (miRNAs), respectively. While details of Dicer regulation by a variety of proteins are being elucidated, less is known about non-protein factors, e.g. RNA molecules, that may influence this enzyme’s activity. Therefore, we decided to investigate the question of whether the RNA molecules can function not only as Dicer substrates but also as its regulators. Our previous in vitro studies indicated that the activity of human Dicer can be influenced by short RNA molecules that either bind to Dicer or interact with its substrates, or both. Those studies were carried out with commercial Dicer preparations. Nevertheless, such preparations are usually not homogeneous enough to carry out more detailed RNA-binding studies. Therefore, we have established our own system for the production of human Dicer in insect cells. In this manuscript, we characterize the RNA-binding and RNA-cleavage properties of the obtained preparation. We demonstrate that Dicer can efficiently bind single-stranded RNAs that are longer than ~20-nucleotides. Consequently, we revisit possible scenarios of Dicer regulation by single-stranded RNA species ranging from ~10- to ~60-nucleotides, in the context of their binding to this enzyme. Finally, we show that siRNA/miRNA-sized RNAs may affect miRNA production either by binding to Dicer or by participating in regulatory feedback-loops. Altogether, our studies suggest a broad regulatory role of short RNAs in Dicer functioning.

Strony (od-do)

773 - 783

DOI

10.18388/abp.2016_1339

Typ licencji

CC BY (uznanie autorstwa)

Tryb otwartego dostępu

otwarte czasopismo

Wersja tekstu w otwartym dostępie

ostateczna wersja opublikowana

Pełny tekst artykułu

Pobierz plik

Poziom dostępu do pełnego tekstu

publiczny

Punktacja Ministerstwa / czasopismo

15

Impact Factor

1,159

Ta strona używa plików Cookies, w celu zapamiętania uwierzytelnionej sesji użytkownika. Aby dowiedzieć się więcej przeczytaj o plikach Cookies i Polityce Prywatności.