Podejścia systemowe do modelowania i analizy wybranych procesów związanych z powstawaniem i rozwojem miażdżycy
[ 1 ] Instytut Informatyki, Wydział Informatyki i Telekomunikacji, Politechnika Poznańska | [ P ] pracownik
[ 1 ] Instytut Informatyki, Wydział Informatyki i Telekomunikacji, Politechnika Poznańska | [ P ] pracownik
polski
- biologia obliczeniowa
- podejścia systemowe
- złożone systemy biologiczne
- sieci Petriego
- miażdżyca
- computational biology
- systems approaches
- complex biological systems
- Petri nets
- atherosclerosis
PL Problemem badawczym niniejszej rozprawy jest zbadanie przydatności różnych metod informatycznych do modelowania i analizy złożonych systemów biologicznych, w szczególności miażdżycy. Rozprawa koncentrujące się na dwóch obszarach: biologicznym (zaproponowaniu modeli) i informatycznym (zastosowaniu różnych podejść do tworzenia i analizy modeli, oraz oceny zastosowanych metodologii). Skoncentrowano się głównie na klasycznych sieciach Petriego, zaproponowano rozszerzenia istniejących metod oraz metody alternatywne. Rozważono aspekty kombinatoryczne wybranych problemów i zaproponowano ich algorytmiczne rozwiązania. Porównano podejścia wykorzystujące sieci Petriego i równania różniczkowe zwyczajne, na podstawie czego zaproponowano podejście dualnego modelowania umożliwiającego przeprowadzenie kompleksowej analizy. Rozważono także alternatywną metodę modelowania opartą o macierzowe modele dynamiki populacji.
EN The research problem of this dissertation is to study the suitability of various computational methods for modelling and analysing complex biological systems, particularly atherosclerosis. The dissertation focuses on two areas: biology (proposing models) and computer science (application of different systems approaches to model development and analysis and the evaluation of the methodologies used). The methodological objective is mainly focused on classical Petri nets, extensions of existing methods and alternative methods are proposed. Combinatorial aspects of selected problems were considered and their algorithmic solutions were proposed. Approaches using Petri nets and ordinary differential equations were compared, resulting in a dual modelling approach being proposed, enabling a comprehensive parametric and structural analysis. An alternative modeling method based on matrix models of population dynamics was also considered.
249
informatyka techniczna i telekomunikacja
DrOIN 2312
publiczny
Anna Gambin
Warszawa, Polska
24.09.2023
polski
publiczny
Andrzej Świerniak
Gliwice, Polska
28.08.2023
polski
publiczny
rozprawa doktorska
Poznań, Polska
04.12.2023
Rada Dyscypliny Informatyka Techniczna i Telekomunikacja Politechniki Poznańskiej
doktor nauk inżynieryjno-technicznych w dyscyplinie: informatyka techniczna i telekomunikacja