Bioinformatyczne metody modelowania i weryfikacji hipotezy Świata RNA
[ 1 ] Instytut Informatyki, Wydział Informatyki, Politechnika Poznańska | [ P ] employee
[ 1 ] Instytut Informatyki, Wydział Informatyki, Politechnika Poznańska | [ P ] employee
EN Bioinformatics methods of modelling and verification of the RNA World hypothesis
polish
- hipoteza Świata RNA
- systemy wieloagentowe
- automaty komórkowe
- teoria gier
- modelowanie systemów
- RNA World Hypothesis
- multi-agent systems
- cellular automata
- game theory
- systems modelling
PL Hipoteza Świata RNA zakłada genezę życia z łańcuchów RNA zdolnych do samodzielnego powielania się. Zaprezentowany w pracy model hipotezy Świata RNA uwzględnia cztery wyodrębnione poziomy organizacji, począwszy od materii nieorganicznej, przez związki organiczne i polimery, po interakcje pomiędzy polimerami. Opisane w pracy badania są skoncentrowane na interakcjach pomiędzy cząsteczkami RNA o charakterze replikaz oraz pasożytów. Dla rozważanego modelu opracowana została formalna definicja w opartym o reguły języku ML-Rules. Ponadto opisane zostały szczegółowo modele wyodrębnionego poziomu organizacji prebiotycznego świata wykorzystujące metody takie jak ewolucyjna teoria gier, równania różniczkowe oraz automaty komórkowe i systemy wieloagentowe. Zbudowane modele miały na celu weryfikację postawionych w niniejszej pracy hipotez badawczych natury biologicznej i podejmują zagadnienie zachowania w systemie informacji zakodowanej w RNA oraz ewolucję systemu złożonego z replikaz i pasożytów.
EN Currently, the most recognized hypothesis of the origins of life is the RNA World hypothesis. It assumes that life was sparked by prebiotic, replicating RNA chains. Presented model of the RNA World hypothesis includes four levels of organization of prebiotic world (inorganic compounds, organic compunds, polymers, interactions). Thesis is concentrated on the last one - interactions between two types RNA molecules: replicases and parasites. It includes a definition of the RNA World hypothesis in the ML-Rules language.The core of the thesis presents four models of these interacting RNA species that utilizes game theory, ordinary differential equation, cellular automata and multi-agent systems. Models were built to allow verification of biological hypotheses that were stated in the thesis. They raise the question of maintaining in the RNA system the information that is coded in RNA and the evolution of the system composes of replicases and RNA parasites.
170
computer sciences and computer science
computer science
DrOIN 1914
public
Wiesław Nowak
Toruń, Polska
23.01.2018
polish
public
Franciszek Seredyński
Warszawa, Polska
25.01.2018
polish
public
dissertation
Poznań, Polska
22.06.2018
Rada Wydziału Informatyki Politechniki Poznańskiej
doktor nauk technicznych w dyscyplinie: informatyka, w specjalności: bioinformatyka