SIS PUT | dr hab. inż. Maciej Antczak

1.

Entanglements of structure elements revealed in RNA 3D models / Mariusz Popenda, Tomasz Żok (WIiT), Joanna Sarzyńska, Agnieszka Korpeta, Ryszard W. Adamiak, Maciej Antczak, Marta Szachniuk (WIiT) // Nucleic Acids Research - 2021, vol. 49, iss. 17, p. 9625-9632

Scientific article 200.0 16.971
2.

New models and algorithms for RNA pseudoknot order assignment / Tomasz Żok (WIiT), Jan Badura (WIiT), Sylwester Swat (WIiT), Kacper Figurski, Mariusz Popenda, Maciej Antczak // International Journal of Applied Mathematics and Computer Science - 2020, vol. 30, no. 2, p. 315-324

Scientific article 100.0 1.417
3.

RNA-Puzzles Round IV: 3D structure predictions of four ribozymes and two aptamers / Zhichao Miao, Ryszard Adamiak, Maciej Antczak (WIiT), Michał Boniecki, Janusz M. Bujnicki, Shi-Jie Chen, Clarence Y. Cheng, Yi Cheng, Fang-Chieh Chou, Rhiju Das, Nikolay V. Dokholyan, Feng Ding, Caleb Geniesse, Yangwei Jiang, Astha Joshi, Andrey Krokhotin, Marcin Magnus, Olivier Mailhot, Francois Major, Thomas H. Mann, Paweł Piątkowski, Radosław Pluta, Mariusz Popenda, Joanna Sarzyńska, Lizhen Sun, Marta Szachniuk (WIiT), Sigi Tian, Jian Wang, Andrew M. Watkins, Jakub Wiedemann (WIiT), Xiaojun Xu, Joseph D. Yesselman, Dong Zhang, Zhenzhen Zhang, Chenhan Zhao, Peinan Zhao, Yuanzhe Zhou, Tomasz Żok (WIiT), Adriana Żyła, Aiming Ren, Robert T. Batey, Barbara L. Golden, Lin Huang, David M. Lilley, Yijin Liu, Dinshaw J. Patel, Eric Westhof // RNA - 2020, vol. 26, no. 12, p. 982-995

Scientific article 140.0 4.942
4.

RNA-Puzzles toolkit: a computational resource of RNA 3D structure benchmark datasets, structure manipulation, and evaluation tools / Marcin Magnus, Maciej Antczak, Tomasz Żok (WIiT), Jakub Wiedemann (WIiT), Piotr Łukasiak (WIiT), Cao Yang, Janusz M. Bujnicki, Eric Westhof, Marta Szachniuk (WIiT), Zhichao Miao // Nucleic Acids Research - 2020, vol. 48, iss. 2, p. 576-588

Scientific article 200.0 16.971
5.

RNAvista: a webserver to assess RNA secondary structures with non-canonical base pairs / Maciej Antczak (WI), Marcin Zabłocki (WI), Tomasz Żok (WI), Agnieszka Rybarczyk (WI), Jacek Błażewicz (WI), Marta Szachniuk (WI) // Bioinformatics - 2019, vol. 35, iss. 1, p. 152-155

Scientific article 200.0 5.610

All articles

1.

Optil.io Platform: Evaluation as a Service for Metaheuristics / Szymon Wąsik (WI), Maciej Antczak (WI), Jan Badura (WI), Artur Laskowski (WI), Maciej Olszowy (WI), Tomasz Sternal (WI), Krzysztof Wędrowicz (WI) // W: Metaheuristics: Proceeding of the MIC and MAEB 2017 Conferences - Barcelona, Spain : Universitat Pompeu Fabra, 2017 - p. 225-227

Chapter in monograph / paper 5.0
2.

Optil.io: Cloud Based Platform For Solving Optimization Problems Using Crowdsourcing Approach / Szymon Wąsik (WI), Maciej Antczak (WI), Jan Badura (WI), Artur Laskowski (WI), Tomasz Sternal (WI) // W: Proceedings of the 19th ACM Conference on Computer Supported Cooperative Work and Social Computing Companion CSCW '16 - New York, United States : ACM, 2016 - p. 433-436

Paper 15
3.

SphereGrinder - reference structure-based tool for quality assessment of protein structural models / Piotr Łukasiak (WI), Maciej Antczak (WI), Tomasz Ratajczak (WI), Jacek Błażewicz (WI) // W: 2015 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), November 9-12, 2015, Washington DC, USA : Proceedings / red. Jun Huan: IEEE, 2015 - p. 665-668

Paper 15

All chapters

1.

Entanglements in RNA 3D structures / Marta Szachniuk (WIiT), Mariusz Popenda, Joanna Sarzyńska, Tomasz Żok (WIiT), Maciej Antczak (WIiT) // r2228_2021

Educational materials
2.

Entanglements of structure elements revealed in RNA 3D models / Mariusz Popenda, Tomasz Żok (WIiT), Joanna Sarzyńska, Agnieszka Korpeta, Ryszard W. Adamiak (WIiT), Maciej Antczak (WIiT), Marta Szachniuk (WIiT) // r1899_2021

Research report
3.

Sekwencyjne algorytmy trasowania z zadanej przez współrzędne geograficzne lokalizacji początkowej do zadanej przez współrzędne geograficzne lokalizacji końcowej oraz obliczenia macierzy odległości oraz macierzy czasów przejazdu między zadanym zbiorem lokalizacji początkowych, a zadanym zbiorem lokalizacji końcowych, wykorzystujących strukturę danych CCH / Tomasz P. Pawlak (WIiT), Sylwester Swat (WIiT), Maciej Antczak (WIiT) // r1352_2020

Source code
4.

RNA-Puzzles Round IV: 3D structure predictions of four ribozymes and two aptamers / Zhichao Miao, Ryszard Adamiak (WIiT), Maciej Antczak (WIiT), Michał J. Boniecki, Janusz M. Bujnicki, Shi-Jie Chen, Clarence Yu Cheng, Yi Cheng, Fang-Chieh Chou, Rhiju Das, Nikolay V. Dokholyan, Feng Ding, Caleb Geniesse, Yangwei Jiang, Astha Joshi, Andrey Krokhotin, Marcin Magnus, Olivier Mailhot, Francois Major, Thomas H. Mann, Paweł Piątkowski, Radoslaw Pluta, Mariusz Popenda, Joanna Sarzyńska, Lizhen Sun, Marta Szachniuk (WIiT), Siqi Tian, Jian Wang, Andrew M. Watkins, Jakub Wiedemann, Xiaojun Xu, Joseph D. Yesselman, Dong Zhang, Zhenzhen Zhang, Chenhan Zhao, Peinan Zhao, Yuanzhe Zhou, Tomasz Żok (WIiT), Adriana Żyła, Aiming Ren, Robert T. Batey, Barbara L. Golden, Lin Huang, David M. Lilley, Yijin Liu, Dinshaw J. Patel, Eric Westhof // r843_2020

Research report
5.

Prediction of four ribozymes and two riboswitches using RNAComposer in RNA-puzzles round IV / Maciej Antczak (WI), Mariusz Popenda, Joanna Sarzyńska, Marta Szachniuk (WI), Zhichao Miao // r318_2019

Research report

All reports

1.

Algorytmiczne aspekty modelowania i ewaluacji biomolekuł / Maciej Antczak (WI) / prom. Marta Kasprzak (WI), Piotr Łukasiak (WI), rev. Krzysztof Giaro, Wiesław Nowak - Poznań, Polska, 2013 - 236 s.

Dissertation

1.

RNAloops: baza struktur wieloramiennych pętli RNA / Jacek Kaczor (WIiT) / prom. Maciej Antczak, rev. Tomasz Żok, 2020

Master thesis
2.

Opracowanie platformy internetowej pozwalającej na identyfikację oraz strukturalne porównywanie deskryptorów. / Tomasz Gwoździk (WI) / prom. Maciej Antczak, rev. Marta Kasprzak, 2018

Master thesis
3.

Opracowanie i zastosowanie łatwo rozszerzalnej architektury aplikacji internetowych / Marcin Zabłocki (WI) / prom. Maciej Antczak, rev. Marta Szachniuk, 2017

Master thesis
4.

Opracowanie ram technologicznych wspierających wzorzec MVC umożliwiających projektowanie wielowarstwowych aplikacji internetowych opartych o architekturę OSGi i język programowania Kotlin / Krystian Panek (WI) / prom. Maciej Antczak, rev. Marta Szachniuk, 2016

Master thesis
5.

Opracowanie i implementacja mechanizmu udostępniającego komunikację realizowaną w czasie rzeczywistym wielu urządzeń mobilnych/stacjonarnych z wykorzystaniem technologii internetowych. / Bartosz Borowski (WI) / prom. Maciej Antczak, rev. Paweł Boiński, 2015

Engineering thesis

All theses

1.

Eksperymentalne porównanie środowisk chmurowych w oparciu o testy wydajnościowe własnej aplikacji internetowej / Jędrzej Magdans (WIiT) / prom. Adam Wojciechowski, rev. Maciej Antczak, 2021

Master thesis
2.

Implementacja i optymalizacja systemu transakcyjnego opartego o metodę Zone Recovery w wersji hybrydowej / Błażej Piaskowski (WIiT) / prom. Adam Wojciechowski, rev. Maciej Antczak, 2021

Master thesis
3.

Optymalizacja gier z użyciem silnika Unity / Szymon Chojnowski (WIiT) / prom. Rafał Klaus, rev. Maciej Antczak, 2021

Master thesis
4.

Process mining - analiza i ulepszanie procesów biznesowych / Szymon Lewek (WIiT) / prom. Rafał Klaus, rev. Maciej Antczak, 2021

Master thesis
5.

Wyznaczanie optymalnej trasy dla robota klasy micromouse przy wykorzystaniu sztucznych sieci neuronowych / Łukasz Statkiewicz (WIiT) / prom. Rafał Klaus, rev. Maciej Antczak, 2021

Master thesis

All theses

System created by Poznań University of Technology and Poznan Supercomputing and Networking Center

Scientific Information System of the Poznań University of Technology

Employee

dr hab. inż. Maciej Antczak

Articles (19)

Chapters (3)

Reports (5)

Dissertation

Supervisor of theses (6)

Reviews of theses (31)